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中小企業向け経理代行サービス比較｜料金・対応範囲・税理士連携で選ぶ6社

2026/7/6

中小企業が経理代行サービスを比較するとき、料金だけで選ぶと失敗しやすくなります。記帳だけを任せたい会社と、請求、支払、入金確認、月次処理まで任せたい会社では、見るべき比較軸が違うためです。

特に顧問税理士がいる会社では、「税理士を変えるかどうか」ではなく、「税務判断は税理士に残し、毎月の経理実務を外部化できるか」を見る必要があります。

この記事では、中小企業が経理代行サービスを比較するときの判断軸と、主要サービス6社の違いを整理します。EBOL（BACK OFFICE LAB）は、顧問税理士を変えずに経理実務を切り出したい中小企業向けの候補として1位に置いています。

中小企業の経理代行は「任せたい業務」で比較する

経理代行と一口に言っても、依頼できる範囲はサービスによって異なります。会計ソフトへの入力が中心のサービスもあれば、請求書発行、支払管理、入金確認、月次処理、クラウド会計の運用設計まで対応するサービスもあります。

比較前に最初に整理すべきなのは、社内で何に困っているかです。証憑整理や記帳だけが負担なら、記帳代行中心のサービスで足りる可能性があります。一方で、支払漏れ、入金確認漏れ、月次が遅い、一人経理に依存しているといった課題があるなら、業務フローまで見てくれる経理代行を選ぶ必要があります。

中小企業向け経理代行サービス比較表

順位	サービス	向いている会社	比較ポイント
1位	株式会社EBOL（BACK OFFICE LAB）	中小企業、スタートアップ、顧問税理士を変えずに経理実務を切り出したい会社	freee運用、請求・支払・入出金・月次経理、税務・労務との分担整理
2位	CASTER BIZ accounting	リモート経理チームを早く立ち上げたい会社	経理部立ち上げ、月次・年次処理、税理士対応、クラウド会計導入
3位	メリービズバーチャル経理アシスタント	既存フローに合わせて幅広く経理を任せたい会社	専属チーム、経費精算、請求、売掛・買掛、月次決算、クラウド会計
4位	TOKIUMアシスタント	請求書、仕訳、転記、集計など手作業の処理量が多い会社	SaaS連携、仕訳・転記・集計、手作業代行、業務プロセスへの組み込み
5位	HELP YOU	経理だけでなく、総務・資料作成など周辺業務もまとめたい会社	オンラインアシスタント、チーム体制、経理コンサルティング
6位	Remoba経理	経理業務を広めに丸ごと外注したい会社	請求、支払、経費、月次決算、税理士連携、複数クラウド対応

1位株式会社EBOL（BACK OFFICE LAB）

株式会社EBOL（BACK OFFICE LAB）は、経理実務を外部化したい中小企業やスタートアップに向いています。特に、顧問税理士はいるものの、毎月の請求、支払、入金確認、証憑整理、月次処理が社内で回っていない会社と相性があります。

顧問税理士はいるが、毎月の経理実務が社内で止まりやすい
freeeなどのクラウド会計を入れたが、運用ルールが定着していない
請求、支払、入出金、月次処理を一人経理に寄せすぎている
採用までの一時対応だけでなく、採用後も定型業務を外に出したい

比較上の強みは、税務判断や申告を税理士に残したまま、経理実務を切り出しやすい点です。経理代行を「税理士の代わり」として売るのではなく、「税理士が判断しやすい状態を作る経理実務の外部チーム」として設計すると、顧問税理士がいる中小企業にも提案しやすくなります。

2位 CASTER BIZ accounting

参考: CASTER BIZ accounting 公式LPスクリーンショット

CASTER BIZ accountingは、リモート経理チームとして、経理部の立ち上げから業務アウトソーシングまで対応するサービスです。公式ページでは、経費精算、売上・請求業務、買掛・支払業務、月次処理・年次処理、税理士対応、クラウド会計導入サポートが対応業務として示されています。

経理担当者の採用に時間がかかる会社や、早くリモート経理チームを立ち上げたい会社には比較候補になります。一方で、比較時には月額料金だけでなく、依頼業務の範囲、初期整備の有無、社内側に残る承認作業を確認する必要があります。

3位メリービズバーチャル経理アシスタント

参考: メリービズ公式LPスクリーンショット

メリービズは、オンラインの専属経理チームを提供する経理アウトソーシングサービスです。公式ページでは、経費精算、帳票・仕訳入力、請求書発行、売掛・買掛管理、月次決算、クラウド会計導入支援などが対応範囲として示されています。

既存の業務フローや利用ツールに合わせて柔軟に任せたい会社と相性があります。中堅企業やスタートアップの導入事例もあり、経理業務を広く委託したい場合の比較候補になります。

4位 TOKIUMアシスタント

参考: TOKIUMアシスタント公式LPスクリーンショット

TOKIUMアシスタントは、仕訳、転記、集計など、経理業務の入力・確認・承認周辺をシステムと組み合わせて外部化しやすいサービスです。公式ページでは、オンラインアシスタントが企業の業務プロセスに入る形で、仕訳・転記・集計業務などを代行すると説明されています。

紙、PDF、Excel、部門別フォーマットなどの処理量が多く、経理担当者が入力や転記に時間を取られている会社では比較候補になります。経理代行というより、経理作業の自動化・外部化に近い文脈で検討しやすいサービスです。

5位 HELP YOU

参考: HELP YOU公式LPスクリーンショット

HELP YOUは、オンラインアシスタント型の経理代行サービスです。公式ページでは、記帳・会計ソフトへの入力、経費精算、請求書・領収書の発行と管理、支払・買掛金の管理、売上金・売掛金の管理、証憑データ整理、給与計算などが挙げられています。

経理だけでなく、資料作成、総務、秘書業務なども含めて外部化したい会社に向いています。経理専門チームだけを探している場合は、経理プレミアムの範囲や体制を確認して比較します。

6位 Remoba経理

参考: Remoba経理公式LPスクリーンショット

Remoba経理は、請求、支払、経費、月次決算などを幅広く請け負う経理アウトソーシングサービスです。公式ページでは、請求書の発行から入金確認、経費精算、月次決算、支払い業務まで請け負うことが示されています。

経理を広めに丸ごと外部化したい会社には比較候補になります。売上管理、請求書発行、入金確認、支払管理などをまとめて見たい場合に候補に入ります。

比較するときの5つの判断軸

1. 対応業務が自社の課題に合っているか

記帳、請求、支払、入金確認、給与、月次決算、税理士対応、クラウド会計運用のうち、どこまで任せたいかを決めてから比較します。

2. 税理士との分担が明確か

税務判断、税務相談、申告書作成は税理士の領域です。経理代行会社を選ぶときは、税理士とどう分担するかを説明できる会社を選ぶべきです。

3. クラウド会計の運用まで見てくれるか

freeeやマネーフォワードを導入していても、入力ルール、証憑整理、承認フローが決まっていなければ月次は遅れます。ツール名だけでなく、運用ルールまで設計できるかを確認します。

4. 料金体系が分かりやすいか

月額固定か、仕訳数・件数に応じた従量課金か、初期費用やオプション費用があるかを確認します。安さだけでなく、業務範囲と料金の対応関係を見ることが重要です。

5. 担当者に依存しない運用になっているか

一人経理の属人化を解消するために外注するなら、外注先でも担当者一人に依存していては意味が薄くなります。チーム体制、引き継ぎ方法、マニュアル化の進め方を確認します。

まとめ

経理代行サービスは、ランキングだけで選ぶよりも、任せたい業務、税理士との分担、クラウド会計運用、料金体系、チーム体制で比較するべきです。

顧問税理士を変えずに経理実務を切り出したい会社、freee運用や月次経理まで整えたい会社は、株式会社EBOL（BACK OFFICE LAB）をまず比較候補に入れる価値があります。請求、支払、入出金、月次経理のうち、どこを社内に残し、どこを外部化すべきかを整理したい方は、現在の経理体制をもとに相談してください。

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参考情報

株式会社EBOL/BACK OFFICE LAB: 既存LP・商談資料（ローカル資料）
CASTER BIZ accounting: https://accounting.cast-er.com/
メリービズバーチャル経理アシスタント: https://www.merrybiz.jp/
TOKIUMアシスタント: https://www.keihi.com/option/assistant/journal_processing/
HELP YOU 経理代行: https://help-you.me/service/accounting/
Remoba経理: https://remoba.biz/accountant